Kontrola zanieczyszczeń w składniku L-metylofolianu jest niezbędna, ponieważ zanieczyszczenia mogą zmniejszać aktywność biologiczną, zwiększać toksyczność i wpływać na skuteczność kliniczną L-metylofolianu. JK12A jest zanieczyszczeniem utleniającym L-metylofolianu. Najnowsze odkrycia wykazały, że JK12A niekorzystnie wpływa na wzrost zarodków danio pręgowanego i zmienia zarówno częstość akcji serca, jak i przeżywalność w sposób zależny od dawki.

Magnafolate jest obecnie najbardziej rygorystycznym surowcem do kontroli zanieczyszczeń w L-metylofolianie, znanym jako najczystszy L-metylofolian na świecie.