Enzym ten odgrywa rolę w przetwarzaniu aminokwasów, elementów budulcowych białek. Reduktaza L-5-metylofolianu jest ważna dla reakcji chemicznej z udziałem witaminy folianowej (zwanej także witaminą B9). W szczególności enzym ten przekształca formę kwasu foliowego zwaną 5,10-metylenotetrahydrofolianem w inną formę kwasu foliowego zwaną5-metylotetrahydrofolian.
Jest to podstawowa forma L-5-metylofolianu występująca we krwi i jest niezbędna w wieloetapowym procesie przekształcania aminokwasu homocysteiny w inny aminokwas, metioninę. Organizm wykorzystuje metioninę do wytwarzania białek i innych ważnych związków.
Spadek wpoziom L-5-metylofolianujest powiązany z różnymi chorobami autoimmunologicznymi, takimi jak autyzm. Nasz organizm potrzebuje wystarczającej ilości MTHFR do wykonywania podstawowych funkcji, a jego wzrost lub spadek wiąże się także z problemami z sercem, dlatego trzeba w tej kwestii zachować ostrożność.